29 июля 1933 г. в Москве создан Центральный научно-исследовательский институт крахмало-паточной промышленности и несвекловичных сахароносов, впоследствии — Центральный НИИ крахмало-паточной промышленности. (Приказ по Народному Комиссариату снабжения СССР № 1119 от 29 июля 1933 г.).
1933-1939 г. – Первый директор института Б.В. Шестаков (заместитель управляющего объединением крахмалопаточной промышленности Наркомснаба РСФСР).
1939 г. – с непосредственным участием сотрудников института создано 14 агрономических опорных пунктов по картофелеводству.
1939-1947 г. – директор института А.Е. Лисицын.
В 1950 г. при институте была открыта аспирантура для подготовки кадров высшей квалификации по направлению 19.06.01 «Промышленная экология и биотехнологии» по научным специальностям 05.18.05 «Технология сахара и сахаристых продуктов, чая, табака и субтропических культур» и 05.17.08 «Процессы и аппараты пищевых производств».
В 1957 г. институт переведен в пос. Коренево Московской обл.
8 мая 1964 г. институт переименован во Всесоюзный НИИ крахмалопродуктов (Приказом Госкомитета по пищевой промышленности при Госплане СССР).
1952-1972 г. – директор института К.И. Пазирук.
1972-1982 г. – директор института Е.А. Штыркова.
20 мая 1992 г. институт переименован во Всероссийский НИИ крахмалопродуктов.
С 21 мая 1998 г. — государственное научное учреждение.
20 июля 2004 г. пос. Коренево вошел в состав пос. Красково Московской обл.
В 2013 г. в связи с реорганизацией системы российских государственных академий наук (РАН, РАМН, РАСХН) институт вошел в структуру Федерального агентства научных организаций (ФАНО), статус института — федеральное государственное бюджетное научное учреждение.
1982-2015 г. – директор института Н.Р. Андреев член-корр. РАН, д-р технических наук.
2015-2017 г. – директор института Д.Н. Лукин кандидат экономических наук.
В 2017 г. институт преобразован в филиал ФГБНУ «Федеральный научный центр пищевых систем им. В. М. Горбатова» (приказ ФАНО России от 17 февраля 2017 г. № 100).
В 2021 г. институт преобразован в филиал ФГБНУ «Федеральный исследовательский центр картофеля имени А.Г. Лорха» и был переименован во Всероссийский научно-исследовательский институт крахмала и переработки крахмалсодержащего сырья (Приказ от 6 декабря 2021 г. Минобрнауки № 1157).
Директор – кандидат сельскохозяйственных наук В.А. Бызов.